iMed Колдонуучунун колдонмосу
Introduction
1.1. Максат
Мунун максаты web Колдонмо чийки маалыматты алуу жана чечим кабыл алууда пайдалуу натыйжаларды бере тургандай аны манипуляциялоого мүмкүндүк берүү болуп саналат. Бул чийки маалыматтар менен моделди үйрөтүү же моделдерди жана анализди колдонуу менен натыйжаны алдын ала айтуу болушу мүмкүн.
1.2. Навигациялык меню
Барактын жогору жагындагы навигациялык менюда сиз керек болгон жерге жетүү үчүн бардык шилтемелер бар. Эгерде сиз адашып калсаңыз, ар дайым артка жебени чыкылдатып, тааныш баракка өтүп, үйгө кайтыңыз же навигациялык менюдан издеп жаткан баракты таба аласыз.
1.3. Каттоо эсеби
Эгер сизде каттоо эсеби жок болсо, тиркемени колдонуу үчүн каттоодон өтүшүңүз керек. Бул үчүн, жогорку оң жактагы эсеп баскычын чыкылдатып, каттоодон өтүңүз. Андан кийин улантуу үчүн колдонуучу атыңызды, сырсөзүңүздү жана электрондук почтаңызды киргизиңиз.
Эгер сизде мурунтан эле каттоо эсеби болсо, колдонуучу атыңыз жана сырсөзүңүз менен кириңиз.
Башкы бет
Барактын сол жагындагы нерселерди чыкылдатуу менен, ар бири эмне кылып жатканын түшүнүүгө жардам берүү үчүн барактын ортосунда ар биринин сүрөттөмөсү пайда болот.
iMedBot
IMedBot тиркемеси колдонуучунун агенттер менен оңой өз ара аракеттенүүсүн шарттаган интерфейсти сунуштайт, бул жекелештирилген болжолдоону жана моделди үйрөтүүнү камсыз кылат. Бул терең изилдөөнүн натыйжаларын онлайн куралга айландыруу үчүн биринчи кадам болуп саналат, ал бул доменде кошумча изилдөө иштерин козгоо мүмкүнчүлүгү бар. Анын тиешелүү колдонуучу колдонмосун бул жерден тапса болот.
Маалыматтарды талдоо
4.1. Кошумчаларды алуу
Бул бөлүм колдонуучуга өз маалымат топтомун түзөтүүгө мүмкүндүк берет. Жаңы берилиштер топтомун жүктөө же ылдый түшүүчү менюдан учурдагыны колдонууну тандай аласыз.
Берилиштер топтому жүктөлүп берилгенден кийин, сиз сол тараптагы менюдагы параметрлердин бирин чыкылдатуу менен кандай иш-аракет кылгыңыз келгенин тандай аласыз.
4.1.1. Чыпкалардын негизинде ички топтомдорду алуу
Бул бөлүм берилген чыпкалардын негизинде баштапкы маалымат топтомунун кичирээк бөлүгүн алууга мүмкүндүк берет. Кошумча топтомдо каалаган маанилерди тандап, андан соң акыркы маалымат топтомунда көрсөтүлгөн тилкелерди тандаңыз.
4.1.2. Сорттолгон натыйжаларды кайтаруу
Бул берилиштер топтомун иреттелген формада кайтарат. Максаттуу тилкени, иреттөө тартибин, кайтарыла турган саптардын санын жана акыркы жыйынтыкта кайсы мамычаларды көрсөтүүнү тандаңыз.
4.1.3. Берилиштер топтомун кеңейтүү
Бул колдонуучуга сөздүк катары сакталган сингулярдык тилкени колдонуучу андан кийин башкара турган иш жүзүндөгү таблицага кеңейтүүгө мүмкүндүк берет. Ал уя салынган маалымат топтомун алат жана колдонуучу талап кылган нерсени эң жогорку катмарга жылдырат. Биринчиден, уя салынган берилиштер топтому бар тилкени камтыган берилиштер топтомун жүктөп бериңиз. Эгер кеңейтүүнү талап кылган тилке автоматтык түрдө аныкталса, кайсы тилкени кеңейтүүнү жана уя салынган маалыматтан кайсы тилкелерди чыгарууну тандаңыз. Тапшыруу чыкылдатыңыз жана сиз жасай аласыз view маалыматыңызды уяланган маалыматтардын ордуна таблицанын мамычалары катары.
4.2. Бириктирүү Files
Ctrl чыкылдатуу менен бир нече берилиштер топтомун тандап жана жүктөө менен (mac үчүн буйрук), бул аларды башка нерсе үчүн колдонулганга караганда чоңураак бир маалымат топтомуна бириктирет.
Жөн гана бардык маалымат топтомдорун тандап, керектүү маалыматты толтуруңуз. Бул жаңы берилиштер топтомун iMed тиркемесинде сактап, андан кийин жүктөп алуу үчүн жеткиликтүү болот.
4.3. Сюжеттик функциялар
Бул бөлүм колдонуучуга өз маалымат топтомун түзүүгө мүмкүндүк берет. Сол жактагы менюдагы варианттардын бирин тандап, анан сюжетті алуу үчүн керектүү талааларды толтуруңуз. Төмөндө маалыматтарыңыздан түзө турган сюжеттердин түрлөрү келтирилген:
4.4. Статистикалык талдоо
Бул бөлүм биздин маалымат топтомубузда статистикалык тесттерди жүргүзүүгө мүмкүндүк берет. Сол жактагы менюдан иштетүү үчүн тестти тандап, сыноолорду жүргүзүү үчүн талааларды толтуруңуз. Төмөндө тесттердин түрлөрү бар:
ODPAC
5.1. Үйрөнүү
Бул барак бул баракта жеткиликтүү ресурстун ар бир түрүнүн кыскача сүрөттөмөсүн камтыйт. Ар бир бөлүмдүн жогору жагындагы баскычты чыкылдатуу колдонуучуга теманы колдонууга же көбүрөөк билүүгө мүмкүндүк берген башка баракка шилтеме берет.
5.1.1. Эпистаз
Бул барак маалыматтан үйрөнүү үчүн MBS издөө алгоритмин колдонууга мүмкүнчүлүк берет. Тактап айтканда, эпистазды, фенотипке таасир этүүчү эки же андан көп гендердин өз ара аракеттенүүсүн изилдөөгө мүмкүндүк берет. Бул профессионалдар үчүн пайдалууfile генетикалык жактан оорулар. Кадимки ыкмалар геномдук ассоциация изилдөөлөрүндө (GWAS) табылган жогорку өлчөмдүү маалыматтарды иштетүү үчүн ылайыктуу эмес. Multiple Beam Search (MBS) алгоритми өз ара аракеттенүүчү гендерди тезирээк аныктоого мүмкүндүк берет. Колдонгуңуз келген маалыматтарды жүктөп, андан кийин керектүү талааларды киргизиңиз. Көбүрөөк маалымат алуу үчүн, толук кагазды бул жерден табыңыз.
5.1.2. Тобокелдик факторлору
Бул барак IGain пакетин маалыматтардын ортосундагы өз ара аракеттенишүүнү үйрөнүүгө мүмкүнчүлүк берет. Ал эвристикалык издөө аркылуу жогорку өлчөмдүү маалыматтардан өз ара аракеттенүүнү атайын үйрөнөт. Бул ыкма төмөн өлчөмдүү маалыматтардан өз ара аракеттенүүнү үйрөнүү үчүн мурда иштелип чыккан Exhaustive_IGain ыкмасына негизделген. Маалыматтарды жүктөп, андан кийин керектүү талааларды киргизиңиз. IS босоголору жана iGain жөнүндө көбүрөөк маалыматты бул жерден тапса болот.
5.1.3. Болжолдоо моделдери
Бул бөлүм аны тездетүү үчүн машина үйрөнүү моделдеринин үстүнө алдын ала түзүлгөн болжолдоо моделдерин колдонууга мүмкүндүк берет. Бул алардын өз маалыматтар топтомун колдонуу менен моделдерди болжолдоо үчүн коддоону жана мурунку тажрыйбаны колдонбостон колдонууга мүмкүндүк берет. Логистика, регрессия, колдоо вектордук машиналары (SVMs), чечим дарактары жана башка көптөгөн нерселер колдонуучуга жеткиликтүү көптөгөн болжолдоо моделдери бар. Болжолдоо ыкмаларынын толук тизмеси бул жерде барактын оң жагында жайгашкан.
5.2. Болжолдоо
Бул бөлүм мурда жүктөлүп берилген бөлүшүлгөн моделден болжолдоого мүмкүндүк берет. Адегенде бөлүшүлгөн моделди жүктөңүз, эгерде буга чейин эле жүктөлбөсө. Андан кийин моделдин атын чыкылдатуу менен болжолдоо үчүн колдонула турган моделди тандаңыз. Андан кийин колдонуу үчүн болжолдоо модели үчүн маалыматтарды жүктөө. Муну кол менен барактын ылдый жагындагы форманы же жүктөп алуу үчүн жеткиликтүү шаблонду колдонуу менен жасоого болот. Эгер шаблон колдонулса, берилиштер топтомун жүктөңүз file жана моделдин болжолун алуу үчүн тапшырууну басыңыз.
5.3. Чечимди колдоо
Чечим колдоо классификацияны камсыз кылат жана системага берилген маалыматтан дарылоону тандоого багыт бере алат. Ал пациенттин өзгөчөлүктөрүнө негизделген оптималдуу дарылоо процедурасын сунуштоо үчүн маалыматтардан үйрөтүлгөн. Клиникалык чечимдерди колдоо системалары (CDSS) жөнүндө көбүрөөк маалымат бул жерден тапса болот.
Системанын сунушу пациенттин өзгөчөлүктөрүн алып, дарылоо процедурасын сунуштайт жана 5 жылдык метастаздын келечектеги ыктымалдыгын болжолдойт. Колдонуучунун кийлигишүүсү оптималдуу дарылоонун ордуна учурдагы дарылоонун негизинде 5 жылдык метастаздын келечектеги ыктымалдыгын алдын ала айтуу үчүн пациенттин өзгөчөлүктөрүн да, дарылоо процедурасын да алат.
MBIL
The Markov Blanket and Interactive Risk Factor Learner (MBIL) бул оорулуунун жыйынтыгына түздөн-түз таасир этүүчү жалгыз жана интерактивдүү тобокелдик факторлорун үйрөнүүчү алгоритм. Бул жерде жайгашкан MBIL пакетинин Python пакетинин индексине (PyPI) багыттоо үчүн "MBILге өтүү" баскычын чыкылдатыңыз. MBIL жөнүндө көбүрөөк маалыматты BMC Bioinformatics сайтынан тапса болот.
Берилиштер топтому
Бул бөлүм колдонуучуга жаңы маалымат топтомдорун көрүүгө жана жүктөөгө мүмкүндүк берет web колдонмо.
7.1. Бардык берилиштер топтомун караңыз
Жеткиликтүү бардык маалымат топтомдорун көрүү үчүн жөн гана "Жеткиликтүү берилиштер топтомун көрсөтүү" баскычын чыкылдатыңыз.
7.2. Берилиштер топтомун жүктөө
Берилиштер топтомун жүктөп берүү үчүн, "Дайындар топтомун бөлүшүү" баскычын чыкылдатып, андан кийин керектүү маалыматты толтуруңуз. webбет. Биринчиден, маалымат топтомун жүктөп жана талап кылынган талааларды толтуруңуз.
Андан кийин, төмөнкү талааларды толтуруңуз же текстти жүктөңүз file толтурулган маалымат мененampКолдонмо аны түшүнүшү үчүн маалыматты кантип уюштуруу керектиги жөнүндө төмөндө келтирилген.
Моделдер
Бул бөлүм колдонуучуга жеткиликтүү моделдерди көрүүгө жана моделди бөлүшүүгө мүмкүндүк берет.
8.1. Жеткиликтүү бардык моделдерди караңыз
Бардык жеткиликтүү моделдерди көрүү үчүн, "Жеткиликтүү моделдерди көрсөтүү" баскычын чыкылдатыңыз.
8.2. Моделди бөлүшүү
Моделди бөлүшүү үчүн, "Моделдериңизди бөлүшүңүз" баскычын чыкылдатып, моделди жүктөңүз file тензордук агым же PyTorch менен үйрөтүлгөн.
8.2.1. Тиешелүү маалыматтар топтому
Андан кийин сиз темаларды камтыган тиешелүү маалымат топтомун жүктөшүңүз керек. Берилиштер топтому үчүн класс/белги акыркы тилкеде болушу керек.
8.2.2. Болжолдоочулар жана Класс маалыматы
Эгерде берилиштер топтому бардык функцияларды камтыса, маалымат топтомун жүктөөдөн кийин функция формасын өткөрүп жиберүүгө болот. Бирок, алардын баары камтылбаса, бул маалымат сыпаттамада көрсөтүлүшү керек file же өзгөчөлүк формасында. Болжолдоочуларды жана класс маалыматын кантип берүү ниетиңизди көрсөтүү менен ачылуучу тизмеден опцияны тандаңыз.
Сүрөттөө опциясын колдонсоңуз, талааларды толтурсаңыз же текстти жүктөсөңүз болот file толтурулган маалымат мененampмаалыматты кантип уюштуруу керектиги төмөндө келтирилген.
Документтер / Ресурстар
 |
Колдонмолор iMed Web Колдонмо [pdf] Колдонуучунун колдонмосу iMed, iMed Web Колдонмо, Web Колдонмо |